盡管現在的平板離心機有的是自動配平的，但對稱放置的物體重量差也要有個限度，一般儀器說明書上都要求在幾克之內。我們知道，離心的兩個物體，一旦重量不相等，勢必發生劇烈的震動。自動配平的離心機的自動配平原理類似洗衣機的脫水桶，將離心轉子頭和驅動電機作為一個整體通過三根彈簧與機體相連，由于有彈簧的存在，不平時會有個傾斜，自身不平引起的震動會小一些，而且傳給外殼也少多了，外加外殼部分也很重，外部感覺震動很小，也就是實現了所謂的自動平衡。但實際上轉動部分內部體系（電機+離心轉頭等）震動還是很厲害的，既然轉的時候有震動，而且這個震動是徑向的（跟電機軸是垂直的），電機軸承平時應該是最好沒有這個力，一旦有這個力的存在，電機軸承久而久之就容易磨損，提前報廢。有的離心機因不平衡導致軸承早早地犧牲，軸承跟軸承座之間都能塞幾張紙進去。不平衡所引起的力是很大的，時間長可能引起疲勞，也要注意有可能導致的斷軸事故。
所以，從這一點來說，最好使對稱放置的提籃能放天平兩個托盤上放一下，一般就是拔掉幾個帽子的事。平了以后別的好處就是聲音非常小，能夠迅速升到預設的速度。
我們在使用平板離心機時，一定要注意配平。具體是在往轉子中放置樣品時，要采用相同密度的樣品、等量軸對稱放置。特別注意不是簡單的對稱，而是軸對稱，既以離心機驅動（軸）為對稱點（軸）的對稱方式，這樣才能保證轉子旋轉起來后的動平衡。